內氏放線菌PCR檢測試劑盒使用方法
使用方法 :
1 實驗所需器材與(yu) 試劑
1.1 器材
1)PCR儀(yi)
2)PCR反應管
3)電泳儀(yi) 及水平電泳槽
4)高速離心機
5)微量移液器及移液器吸頭
1.2 試劑
1)瓊脂糖
2)EB(溴化乙錠)
3)去離子水或雙蒸水
反應五要素:
參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特異性反應的關(guan) 鍵,PCR 產(chan) 物的特異性取決(jue) 於(yu) 引物與(yu) 模板DNA互補的程度。理論上,隻要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體(ti) 外大量擴增。設計引物應遵循以下原則:
①引物長度: 15-30bp,常用為(wei) 20bp左右。
②引物擴增跨度: 以200-500bp為(wei) 宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為(wei) 宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC*隨機分布,避免5個(ge) 以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物內(nei) 部出現二級結構,避免兩(liang) 條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會(hui) 形成引物二聚體(ti) ,產(chan) 生非特異的擴增條帶。
⑤引物3'端的堿基,特別是末及倒數第二個(ge) 堿基,應嚴(yan) 格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列*有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。
⑦引物的特異性:引物應與(yu) 核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性。
引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以*引物量產(chan) 生所需要的結果為(wei) 好,引物濃度偏高會(hui) 引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體(ti) 的機會(hui) 。
注意事項:
5.1使用本試劑前請仔細閱讀本說明書(shu) 全文。
5.2 操作時應盡量少說話,因口腔中也含有支原體(ti) ,可能引起樣品汙染,而造成假陽性;整個(ge) 檢測過程中,反應體(ti) 係的配製、樣本處理及加樣、PCR擴增應分區域進行,以避免交叉汙染。 5.3 實驗時,試劑盒組分中的試劑使用前應充分融化並混勻(混勻時禁止激烈振蕩,隻需要進行上下倒置多次進行混勻)。
5.4 反應管中加好所有的試劑後,應盡快上PCR儀(yi) 進行擴增,以免形成過多的二聚體(ti) 。
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