豬胸膜肺炎放線杆菌PCR試劑盒產生各種條帶的常見原因
產(chan) 生各種條帶的常見原因
1.產(chan) 生非特異性條帶
1)用RT陰性對照檢測是否被基因組DNA汙染。如果RT陰性對照的PCR結果也顯示同樣條帶,則需要用DNase I重新處理樣品。
2)在PCR反應中,非特異的起始擴增將導致產(chan) 生非特異性結果。在低於(yu) 引物Tm 2至5℃的溫度下進行退火,降低鎂離子或是目的DNA的量將減少非特異性結果的產(chan) 生。
3)由於(yu) mRNA剪切方式的不同,根據選擇引物的不同將導致產(chan) 生不同的RT-PCR結果。
2. 產(chan) 生彌散(smear)條帶
1)在PCR反應體(ti) 係中di一鏈產(chan) 物的含量過高
2)減少引物的用量
3)優(you) 化PCR反應條件/減少PCR的循環次數
4)在用DNase處理被DNA汙染的RNA樣品時,其產(chan) 生的寡核苷酸片段會(hui) 產(chan) 生非特異性擴增,一般會(hui) 顯示為(wei) 彌散背景。
3. 產(chan) 生大分子量的彌散條帶
1)大多數情況下是由於(yu) 退火溫度過低而導致的非特異性的起始及延伸產(chan) 生的
2)對於(yu) 長片段的PCR,建議將反應體(ti) 係中cDNA的濃度稀釋至1:10(或1:100-1:200)
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